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自1900年代初以来，研究人员就知道某些细胞具有在体内生成血细胞的能力。上世纪70年代末，科学家们在人类脐带血中发现了干细胞，此后不久，成功地创造了个体外 （体外）干细胞。这在那些认为将人类胚胎用于科学研究是错误的人和那些认为胚胎是科学研究发展的关键工具的人之间引发了严重的分歧。（BioInformant在这个问题上不表态。）多年来，干细胞研究陷入了这种僵，随着乔治·W·布什 (George W. Bush) 于2001年禁止干细胞实验的行政命令，研究进一步落后。
干细胞治疗是利用干细胞的分化潜能，将健康的干细胞移植到患者体内，进而达到组织再生修复的作用。
造血干细胞是血液系统中的成体干细胞，具有长期自我更新能力和分化成各类成熟血细胞的潜能。造血干细胞移植可以成功治疗某些血液病患者。干细胞生成组织的应用还包括烧伤治疗、骨移植和角膜移植等。用于其他疾病（视网膜疾病、帕金森病、心肌梗死）组织替代治疗仍在研发阶段。
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组织特异性干细胞是多能干细胞，因为它们可以变成许多不同但不是类型的细胞。多能干细胞之所以如此命名，是因为它们能够转化为体内的细胞。这些仅在胚胎发育的早阶段被发现。2006 年，科学家们还发现了一种“导”多能性的方法，如下文导多能干细胞 (iPSC) 部分所述。全能干细胞具有与多能干细胞相同的能力，因为它们可以变成体内组织的组成部分。然而，它们还具有长成胚胎细胞和发育中胎儿的能力，这是其他干细胞类型无法做到的。
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使用MSCs进行干细胞治疗的主要好处之一是它们可以很容易地从各种来源获得并在实验室中扩展。MSC的免疫排斥风险也较低，因为它们的免疫原性低于其他干细胞。总的来说，使用MSCs进行干细胞治疗对治疗各种疾病和病症具有广阔的前景。虽然需要更多的研究来充分了解这些细胞的潜力并使用MSC开发有效的治疗方法，但早期结果令人鼓舞。MSC有潜力成为再生医学领域的宝贵工具。再生医学是一个多学科领域，涉及更换、修复或再生受损的身体器官、组织和细胞。它是一种基于细胞的疗法，包括注射干细胞或祖细胞以及通过生物活性分子导生成。移植细胞的目标是通过减轻症状和稳定医疗状况来减轻人类疾病的影响。
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