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此外，。例如，这些刺激物可以包括生长因子（告诉干细胞如何生长的化学物质）和形态发生因子（指导干细胞形成哪种组织的化学物质）。。这些材料有时是有机的，有时是实验室制造的，干细胞可以在其上生长以产生新的身体组织。组织工程仍处于起步阶段，但已被明是导新器官和其他组织类型生长的关键因素。虽然研究人员对干细胞行为以及导致它们变成其他细胞的原因知之甚少，但这一领域的知识正在不断扩展。
按分化潜能，干细胞可分为，全能干细胞，多能干细胞，单能干细胞。
全能干细胞:具有形成完整个体的分化潜能，如受精卵。
多能干细胞:具有分化出多种细胞组织的潜能。如胚胎干细胞（ES）。
单能干细胞:只能向一种或两种密切相关的细胞类型分化。如神经干细胞、造血干细胞。
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干细胞疗法存在许多风险。首先， 移植物抗宿主病的风险伴随着同种异体干细胞移植——一种使用供体细胞而不是患者自身细胞的移植。在这种情况下，供体细胞在进入宿主体内后可能会启动针对宿主的免疫反应。它们攻击宿主细胞，就好像它们是供体自身体内的外来入侵者一样。这会导致腹泻、皮疹、眼睛刺激，如果持续时间长，甚至会导致死亡。当然，也有可能宿主也会排斥移植物，这也会导致疾病，如果移植物不接受，就会死亡。
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这种干细胞类型比其他类型都更令医学界兴奋。导性多能干细胞 （iPSC或iPS细胞）是科学家们导其恢复到多能性早期阶段的成体干细胞，即能够转化为人体内细胞的能力。这些细胞可能会为医生提供替换人体部分所需的工具，而无需从胚胎状态中采集这些细胞。导多能干细胞仍处于临床开发的早期阶段，但研究正在取得进展。。正在探索这种iPS细胞衍生产品 (CYP-001) 治疗称为移植物抗宿主病 (GvHD) 的破坏性疾病的能力。
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